Tren Urbano, el primer proyecto de transporte público en la historia de Puerto Rico, se inauguró en 2005 y conecta San Juan con suburbios como Santurce, Bayamón y Guaynabo. Con un costo de alrededor de $ 2 mil millones, el sistema proporciona un modo de transporte fácil a las áreas más congestionadas del área metropolitana de San Juan. Durante las horas pico (5-9am y 3-6pm), el tren opera cada 8 minutos; de lo contrario, se ejecuta cada 12 minutos. No hay servicio todos los días de 11:20 pm a 5:30 am. La tarifa es de 75 ¢ por trayecto e incluye un traslado a los autobuses. Es un paseo hermoso y brinda a los turistas una experiencia diferente de la ciudad; el tren pasa por una vía elevada a través del moderno distrito financiero de Hato Rey, se sumerge bajo tierra en Río Piedras y luego serpentea por barrios suburbanos de lujo, con follaje tropical y piscinas en muchos patios traseros. La tarifa incluye una transferencia porque se ha creado una clase especial de autobuses para conectar con rutas particulares de Tren Urbano.

El tren y los autobuses que lo acompañan mantienen horarios especiales ampliados durante los grandes eventos, como festivales en el Viejo San Juan. También extienden los horarios cuando los grandes actos juegan en el Coliseo de Puerto Rico, o la Compañía de Turismo organiza una fiesta de Nochevieja en el Centro de Convenciones.